MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013714	TGC	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454960
2	NC_013714	CCGC	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	283454960
3	NC_013714	GCTG	2	8	104	111	0 %	25 %	50 %	25 %	283454960
4	NC_013714	CAG	2	6	178	183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454960
5	NC_013714	AACC	2	8	202	209	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
6	NC_013714	CCG	2	6	233	238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454960
7	NC_013714	GCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454960
8	NC_013714	GGC	2	6	586	591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454960
9	NC_013714	TTG	2	6	613	618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454960
10	NC_013714	ACCA	2	8	721	728	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
11	NC_013714	CCG	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454960
12	NC_013714	CTG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454960
13	NC_013714	CGA	2	6	789	794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454960
14	NC_013714	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454960
15	NC_013714	GCC	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454960
16	NC_013714	ATG	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454960
17	NC_013714	CCA	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454960
18	NC_013714	CAAC	2	8	1137	1144	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
19	NC_013714	TTC	2	6	1183	1188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454960
20	NC_013714	CAT	2	6	1218	1223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454960
21	NC_013714	CGA	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454960
22	NC_013714	TCG	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454960
23	NC_013714	CGG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454960
24	NC_013714	ACCAC	2	10	1382	1391	40 %	0 %	0 %	60 %	283454960
25	NC_013714	CATG	2	8	1395	1402	25 %	25 %	25 %	25 %	283454960
26	NC_013714	AGC	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454960
27	NC_013714	ACC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454961
28	NC_013714	GGCA	2	8	2067	2074	25 %	0 %	50 %	25 %	283454961
29	NC_013714	CGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454961
30	NC_013714	AGA	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454961
31	NC_013714	CCTA	2	8	2234	2241	25 %	25 %	0 %	50 %	283454961
32	NC_013714	GACCAT	2	12	2256	2267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283454961
33	NC_013714	TCA	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454961
34	NC_013714	ACCG	2	8	2482	2489	25 %	0 %	25 %	50 %	283454961
35	NC_013714	CGA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454961
36	NC_013714	CCG	2	6	2705	2710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454961
37	NC_013714	CGA	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454961
38	NC_013714	CCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454961
39	NC_013714	CGG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454961
40	NC_013714	CAG	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454961
41	NC_013714	CGA	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454961
42	NC_013714	CCAT	2	8	3181	3188	25 %	25 %	0 %	50 %	283454962
43	NC_013714	GA	3	6	3370	3375	50 %	0 %	50 %	0 %	283454962
44	NC_013714	CCA	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454962
45	NC_013714	TCA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454962
46	NC_013714	AAC	2	6	3662	3667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454962
47	NC_013714	AGC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454962
48	NC_013714	GTG	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454962
49	NC_013714	GCC	2	6	3730	3735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454962
50	NC_013714	CAG	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454962
51	NC_013714	TTG	2	6	3877	3882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454962
52	NC_013714	CTT	2	6	3893	3898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454962
53	NC_013714	CGA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454962
54	NC_013714	GAT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454962
55	NC_013714	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454962
56	NC_013714	TGACGT	2	12	4016	4027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283454962
57	NC_013714	GCATG	2	10	4029	4038	20 %	20 %	40 %	20 %	283454962
58	NC_013714	CAG	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454962
59	NC_013714	GAT	2	6	4153	4158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454962
60	NC_013714	CGC	2	6	4239	4244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454962
61	NC_013714	CGA	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454962
62	NC_013714	TGA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454962
63	NC_013714	TCC	2	6	4385	4390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454963
64	NC_013714	CTG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454963
65	NC_013714	CGGG	2	8	4523	4530	0 %	0 %	75 %	25 %	283454963
66	NC_013714	GGT	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454963
67	NC_013714	CAT	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454963
68	NC_013714	CAG	3	9	4812	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454963
69	NC_013714	AGGA	2	8	5080	5087	50 %	0 %	50 %	0 %	283454964
70	NC_013714	CGA	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454964
71	NC_013714	TCCG	2	8	5260	5267	0 %	25 %	25 %	50 %	283454964
72	NC_013714	TCG	2	6	5323	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454964
73	NC_013714	CGA	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454964
74	NC_013714	CGA	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454964
75	NC_013714	TGA	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454964
76	NC_013714	GGC	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
77	NC_013714	CGG	4	12	5507	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
78	NC_013714	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
79	NC_013714	CGT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454964
80	NC_013714	ACC	3	9	5736	5744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454964
81	NC_013714	CAG	2	6	5775	5780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454964
82	NC_013714	GGCG	2	8	5840	5847	0 %	0 %	75 %	25 %	283454964
83	NC_013714	ACC	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454964
84	NC_013714	CCA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454964
85	NC_013714	GGC	2	6	6099	6104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
86	NC_013714	GCG	2	6	6126	6131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
87	NC_013714	GA	3	6	6160	6165	50 %	0 %	50 %	0 %	283454964
88	NC_013714	CAAGGA	2	12	6176	6187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283454964
89	NC_013714	CGA	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454964
90	NC_013714	AGT	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454964
91	NC_013714	AGACCA	2	12	6271	6282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	283454964
92	NC_013714	TGA	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454964
93	NC_013714	CAT	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454964
94	NC_013714	GC	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
95	NC_013714	AAG	2	6	6423	6428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454964
96	NC_013714	CGT	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454964
97	NC_013714	CGGC	2	8	6466	6473	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
98	NC_013714	CAA	2	6	6503	6508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454964
99	NC_013714	GGC	2	6	6552	6557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
100	NC_013714	GC	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
101	NC_013714	ATG	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454964
102	NC_013714	CCG	2	6	6682	6687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454964
103	NC_013714	CGG	3	9	6689	6697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454964
104	NC_013714	TCA	3	9	6742	6750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454964
105	NC_013714	GCCGAT	2	12	6753	6764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283454964
106	NC_013714	TTC	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454964
107	NC_013714	GAT	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454964
108	NC_013714	TACGTG	2	12	6840	6851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283454964
109	NC_013714	GCC	2	6	6857	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454964
110	NC_013714	AAGGC	2	10	6940	6949	40 %	0 %	40 %	20 %	283454964
111	NC_013714	GCCG	2	8	6951	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
112	NC_013714	ACC	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454964
113	NC_013714	GCGGCC	2	12	7083	7094	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
114	NC_013714	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454964
115	NC_013714	ACA	3	9	7229	7237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454965
116	NC_013714	ACA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454965
117	NC_013714	TGA	2	6	7316	7321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454965
118	NC_013714	AGA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454965
119	NC_013714	TCG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
120	NC_013714	ACG	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
121	NC_013714	TCG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
122	NC_013714	CGA	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
123	NC_013714	TGC	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
124	NC_013714	CCA	2	6	7847	7852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454965
125	NC_013714	CGC	2	6	7859	7864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454965
126	NC_013714	ACA	2	6	7865	7870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454965
127	NC_013714	AGCC	2	8	7917	7924	25 %	0 %	25 %	50 %	283454965
128	NC_013714	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454965
129	NC_013714	CGA	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
130	NC_013714	TACCG	2	10	8020	8029	20 %	20 %	20 %	40 %	283454965
131	NC_013714	TGCG	2	8	8048	8055	0 %	25 %	50 %	25 %	283454965
132	NC_013714	ATCC	2	8	8142	8149	25 %	25 %	0 %	50 %	283454965
133	NC_013714	GGT	2	6	8262	8267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454965
134	NC_013714	CAA	2	6	8271	8276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454965
135	NC_013714	GCA	2	6	8298	8303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
136	NC_013714	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
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139	NC_013714	CGA	2	6	8643	8648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
140	NC_013714	CGA	2	6	8736	8741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
141	NC_013714	TCG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
142	NC_013714	CGC	2	6	8767	8772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454965
143	NC_013714	CGTGAC	2	12	8838	8849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283454965
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152	NC_013714	CTG	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454965
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155	NC_013714	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454965
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157	NC_013714	CGA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454965
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245	NC_013714	ATGGGC	2	12	14743	14754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283454969
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247	NC_013714	CAT	2	6	14922	14927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454969
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250	NC_013714	GCT	2	6	15105	15110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454970
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254	NC_013714	ATTCC	2	10	15230	15239	20 %	40 %	0 %	40 %	283454970
255	NC_013714	TGA	2	6	15291	15296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454970
256	NC_013714	CAA	2	6	15345	15350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454970
257	NC_013714	GCG	2	6	15369	15374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454970
258	NC_013714	TCG	2	6	15479	15484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454970
259	NC_013714	TGG	2	6	15489	15494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454970
260	NC_013714	CGA	2	6	15537	15542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454970
261	NC_013714	GAA	2	6	15597	15602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454970
262	NC_013714	CGA	2	6	15635	15640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454970
263	NC_013714	GAA	2	6	15669	15674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454970
264	NC_013714	AGC	2	6	15746	15751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454970
265	NC_013714	TCAA	2	8	15773	15780	50 %	25 %	0 %	25 %	283454970
266	NC_013714	TCG	2	6	15893	15898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454971
267	NC_013714	CGC	2	6	16087	16092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454971
268	NC_013714	ATTT	2	8	16156	16163	25 %	75 %	0 %	0 %	283454971
269	NC_013714	GCT	2	6	16177	16182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454971
270	NC_013714	TTG	2	6	16202	16207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454971
271	NC_013714	TGG	2	6	16298	16303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454971
272	NC_013714	TGAT	2	8	16382	16389	25 %	50 %	25 %	0 %	283454971
273	NC_013714	GCTG	2	8	16401	16408	0 %	25 %	50 %	25 %	283454971
274	NC_013714	GGA	2	6	16437	16442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283454971
275	NC_013714	TCA	3	9	16517	16525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454971
276	NC_013714	TCG	2	6	16601	16606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454971
277	NC_013714	CGT	2	6	16611	16616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454971
278	NC_013714	TCA	2	6	16655	16660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454971
279	NC_013714	GTT	2	6	16692	16697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454971
280	NC_013714	TTCCGA	2	12	16740	16751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283454971
281	NC_013714	ATCG	2	8	16901	16908	25 %	25 %	25 %	25 %	283454972
282	NC_013714	GAA	2	6	16939	16944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454972
283	NC_013714	CAT	2	6	16963	16968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454972
284	NC_013714	CGA	2	6	17071	17076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454972
285	NC_013714	CCGCT	2	10	17170	17179	0 %	20 %	20 %	60 %	283454972
286	NC_013714	ATG	2	6	17187	17192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454972
287	NC_013714	TGA	3	9	17196	17204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454972
288	NC_013714	CTG	2	6	17210	17215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454972
289	NC_013714	GC	3	6	17228	17233	0 %	0 %	50 %	50 %	283454972
290	NC_013714	TGA	2	6	17287	17292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454972
291	NC_013714	GTGC	2	8	17321	17328	0 %	25 %	50 %	25 %	283454972
292	NC_013714	CAT	2	6	17387	17392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454972
293	NC_013714	GCC	2	6	17396	17401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454972
294	NC_013714	ACATCG	2	12	17415	17426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283454972
295	NC_013714	TCA	2	6	17427	17432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454972
296	NC_013714	CGA	2	6	17455	17460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454972
297	NC_013714	AGGA	2	8	17486	17493	50 %	0 %	50 %	0 %	283454972
298	NC_013714	AATGA	2	10	17494	17503	60 %	20 %	20 %	0 %	283454972
299	NC_013714	ACA	2	6	17507	17512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454973
300	NC_013714	TCG	2	6	17531	17536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454973
301	NC_013714	GGGA	2	8	17630	17637	25 %	0 %	75 %	0 %	283454973
302	NC_013714	ATG	2	6	17674	17679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454973
303	NC_013714	ATG	2	6	17701	17706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454973
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309	NC_013714	CCGATG	2	12	18011	18022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283454973
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342	NC_013714	GAT	2	6	20663	20668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454976
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354	NC_013714	GCA	2	6	21252	21257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454977
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374	NC_013714	GTGC	2	8	22290	22297	0 %	25 %	50 %	25 %	283454978
375	NC_013714	GCA	2	6	22375	22380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454978
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377	NC_013714	ATG	2	6	22398	22403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454978
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381	NC_013714	GAT	2	6	22652	22657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454978
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383	NC_013714	CGC	2	6	22810	22815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454978
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